Храм был освящен в 1806 году, с открытием больничного комплекса на Новой Божедомке (ныне - улица Достоевского). Первоначально больница находилась в ведомстве Императрицы Марии Федоровны, матери государя Александра I, поэтому была названа Мариинской. В создании комплекса, который в настоящее время признан памятником архитектуры федерального значения, принимали участие такие известные архитекторы как И. Жилярди и Д. Кваренги.
В одном из флигелей Мариинской больницы родился Ф. М. Достоевский. Долгое время он жил здесь, поскольку отец известного писателя был лекарем. С 1918 года корпуса больницы стали использоваться исключительно как здания медицинского учреждения по борьбе с туберкулезом. Храм был закрыт и по назначению не использовался.
В 2002 году руководство ММА им. И.М. Сеченова приняло решение о восстановлении храма. Силами Академии и НИИ Фтизиопульмонологии храм был восстановлен и в 2004 году 12 июля - день памяти святых Первоверховных апостолов, в престольный праздник храма, по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II, состоялось малое освящение и совершена первая Божественная Литургия.
Информация предоставлена старостой храма