После того как в 1892 году Самару миновала эпидемия холеры, торговцы мясом, державшие свои лавки на Троицком базаре, решили устроить часовню-киот в память об избавлении города от этого бедствия. 9 марта следующего года Городская Дума выделила необходимое место среди торговых рядов, где киот и был установлен. С двух его сторон были размещены одни из самых чтимых в городе образов - Смоленской иконы Божией Матери и святителя Алексия Московского, небесного покровителя Самары. Когда в начале 20 столетия деревянные лавки Троицкого рынка были заменены на 12 кирпичных павильонов, решено было привести в соответствующий вид и часовню, оказавшуюся теперь в окружении новых благоустроенных зданий.

В 1907 году новая часовня, сохранившая посвящение своей предшественницы, была возведена по проекту архитектора А.А. Щербачёва. Своими габаритами (после пристройки в 1912-1914 годах двух тамбуров с южной и северной стороны часовня стала больше походить на полноценную церковь) и архитектурным оформлением часовня в Троицких торговых рядах сильно напоминала Казанскую часовню в Иверском женском монастыре, также не сохранившуюся до наших дней. До конца 1920-х годов часовня оставалась действующей и была приписана к соседней церкви Троицы Живоначальной; после закрытия она была переоборудована под склад Горторготдела. После Великой Отечественной войны в бывшей часовне недолгое время помещалась Покровская церковь старообрядцев-беглопоповцев (впрочем, неизвестно, имела ли общины официальный статус). Приблизительно в 1958 году окончательно закрытая часовня была полностью снесена.

По материалам статьи из книги "Православные святыни Самарского края", 2001 г.