Микрорайон Малинники был образован во второй половине XX в. Его застройка велась в связи с развитием Калуги как промышленного центра, здесь расположен ряд крупных предприятий города. На его территории разместилось новое городское кладбище.
В марте 2000 г. под духовным руководством игумена Пафнутия (Морозова) на кладбище было начато строительство храма в честь мученика Трифона. Распоряжением № 2629-р от 3 августа 2000 г. Городская управа предоставила землю под храм. На время строительства храма службы проводились в маленькой часовне в честь Калужских подвижников благочестия. В декабре 2001 г. были завершены строительно-монтажные работы и наружная отделка, здание храма было принято государственной комиссией в декабре 2001 г. В часовне службы прекратились и она в данный момент используется больше как хозяйственное помещение для нужд храма.
Написано со слов духовенства епархии.