До 1766 года на этом месте находился деревянный храм, но к тому времени он сильно обветшал и был разобран. Каменная церковь в честь Спаса Преображения была возведена в 1766-1768 гг. на средства священника ф. Шупинского и коллежского асессора С. Корсакова. Церковь выстроена в стиле позднего барокко в типично смоленском варианте. Храм двухэтажный: в верхнем храме находился Преображенский (летний) престол, в нижнем (зимнем) - мученицы Параскевы и священномученика Антипы. В приходе почиталась икона Божией Матери "Всех скорбящих Радость".
Во время Отечественной войны 1812 года, при захвате города французами, в этом храме находилась тюрьма - содержались под арестом русские партизаны и организаторы паризанского движения С. И. Шубин и П. И. Энгельгардт. Их расстреляли в октябре того же года.
В 1929 году храм большевики закрыли, предварительно вынеся из него всё церковное имущество. Венчания были сбиты, а верхний ярус колокольни был позже разобран. Здание бывшей церкви было передано на нужды Народного Комиссариата Обороны.
В годы Великой Отечественной войны храм Спаса Преображения частично был разрушен. После войны его немного восстановили и в 1978 году местные власти отдали под общежитие для сотрудников Смоленских реставрационных мастерских. Внутри помещение было капитально перестроено, на здании надстроили ещё один этаж. В этом здании почти 40 лет, до расселения, жили люди.
Буквально пару лет назад это строение совсем не напоминало проходящему мимо прохожему, что некогда эдесь находился православный храм. На стенах с обвалившейся штукатуркой, были прикреплены "тарелки" спутникового ТВ. Невысокое крылечко - пара ступеней под покатой металлической крышей с кованными узорами, небольшая обитая листами жести дверь без замка. За ней - выцветшие двери квартир обывателей, среди которых были иконописцы, художники, реставраторы и архитекторы (всего около двух десятков человек) и маленький холл. Всякий, кто впервые попадал внутрь этого здания, испытывал странные ощущения диссонанса - вроде бы общежитие, но одновременно присутствие очертаний церковной архитектуры.
По документам здание считалось памятником архитектуры (даже была прикреплена издевательская табличка), в котором жильцов как бы и не было. Пару лет назад "квартирантов" из бывшей церкви расселили, а здание отдали Смоленской Епархии. 4 марта 2019 года в храме прошёл первый молебен за последние 90 лет - эта дата считается началом возрождения святыни. Первое архирейское богослужение правящий архирей митрополит Смоленский и Дорогобужский Исидор совершил 18 августа 2019 года. 7 января 2020 года в церкви Спаса Преображения состоялось первое Рождественское богослужение за 90 лет во вновь открывшемся храме. 21 января 2020 года был освящён и установлен на колокольне купол с крестом.
Из буклета: "Смоленские Святыни". - Смоленск; издательство "Свиток", 2016