Колокольня была сооружена на месте разобранной надвратной церкви Усекновения главы Иоанна Предтечи в 1806-1807 гг. по заказу и на средства митрополита Амвросия. Первоначально колокольня была надвратной, четырехъярусной. После закрытия монастыря в 1920 году колокольня не использовалась. Оставалась неразрушенной, по крайней мере, до 1948 года. В настоящее время у колокольни отсутствуют два верхних яруса, утрачены колокола.