Безапсидная квадратная в плане Сретенская церковь, примыкающая с востока к монастырской трапезной палате - одна из "типовых" трапезных церквей, строившихся в монастырях Новгорода и епархии (Хутынском, Александро-Свирском) в XVI в. Эти храмы имеют декоративную главу, внутреннее их пространство перекрыто плоским куполом на тромпах. В XIX в. церковь с трапезной использовалась для нужд помещавшейся в монастыре Новгородской духовной семинарии: семинаристы учились в ней читать за богослужением, петь, произносить проповеди. При имп. Александре II семинарию задумали вывести из монастыря в город, но после его убийства решение отменили. В новом семинарском корпусе, выстроенном в 1888-1890 гг. на месте старых семинарских построек, помещение для церкви не было предусмотрено.
В ноябре 1900 г. в Сретенской церкви случился пожар - сгорел иконостас. Её наскоро привели в порядок, а летом - осенью 1901 г. капитально отремонтировали. В ходе работ, в частности, были найдены и очищены вмурованные во внешние стены храма кресты. Храм стал вполне благолепным, но его теснота, как семинарского храма, стала ещё более заметна. По ходатайству ректора семинарии архимандрита Димитрия (Сперовского) было получено разрешение расширить храм пристройкой северного придела. Его достаточно аккуратно "прислонили" к стене трапезной палаты, почти не касаясь древней Сретенской церкви. Новый обширный придел был освящён в октябре 1904 г. во имя свт. Тихона Задонского, выпускника Новгородской семинарии.
В настоящее время Сретенская церковь является храмом Новгородского гос. университета (освящена 15 (2) февраля 2019 г.); при ней (в помещениях подклета) работает учебно-научный духовно-просветительный центр "Сретение в Антонове".