В 1851 г. на Софийской набережной было открыто училище Дамского попечительства о бедных. Однако изначально находилось в наемных помещениях. На территории усадеб Еропкиных, Зубовых, Дурасовых (более известна как «усадьба Дурасовых») в 1860 г. был приобретен собственный трехэтажный дом, где помещалось Мариинское училище. Чуть позже было принято решение об обустройстве домового храма. Для этих нужд с восточной части здания выполнена пристройка.
Церковь располагалась в верхнем двухсветном зале, притвор и трапезная помещались в примыкающих комнатах старой части дома. В конце апреля 1863 г. Богородицкую церковь освятили. В 1875 г. здание претерпело существенных изменений, большая часть которого подлежала перестройке, собственно, в таком виде училище сохранилось до наших дней. В 1878 г. был учрежден самостоятельный причт.
В 1918 г. церковь опечатали, в 1921 г. имущество передали в действующие сельские церкви, главу сломали, интерьер уничтожили. До 1960-х гг. здесь находилась школа № 19 им. Белинского. После дом отдали для проектных организаций, которые находятся там и сегодня.