В 1899 году на третьем этаже здания по проекту инженера Евгения Сафонова строится домовая церковь в честь св. великомученицы Ксении ( церковь Ксении преподобной при женском училище им . великой княгини Ксении Александровны ). Церковь примыкала к большому актовому залу и была освящена 28 января 1901 года.
В 1920 году, в эпоху всеобщей борьбы с наследием царского режима, церковь была ликвидирована.