Микрорайон Малинники был образован во второй половине XX в. Его застройка велась в связи с развитием Калуги как промышленного центра, здесь расположен ряд крупных предприятий города. На его территории расположено городское кладбище. В марте 2000 г. под духовным руководством игумена Пафнутия (Морозова) на кладбище было начато строительство храма в честь мученика Трифона. Проектно-сметная документация на строительство храма разработана главным архитектором области И.А. Савичевым. Распоряжением № 2629-р от 3 августа 2000 г. Городская управа предоставила землю под храм. Строительство осуществлялось на средства, выделенные В.А. Дубровиным, генеральным директором Калужского предприятия «Ремпутьмаш». В декабре 2001 г. были завершены строительно-монтажные работы и наружная отделка, здание храма было принято государственной комиссией в декабре 2001 г.
14 февраля 2002 г., в престольный праздник — день памяти мученика Трифона в нем была совершена первая Божественная Литургия. В настоящее время ведутся внутренняя отделка и благоустройство территории. Храм осуществляет свою деятельность как Архиерейское подворье.
Материалы из книги «Земля Калужская – земля Святая», 2003 г.