29 марта 1903 года в Москве, на четвёртом этаже нового здания балетного отделения императорского театрального училища, была освящена домовая церковь во имя Марии Магдалины. В то время училище называлось Московской театральной школой. Школа была расположена в одном из зданий на Охотном ряду, неподалёку от Петровского театра. Владельцем помещения была дирекция Московских императорских театров.
Во время нашествия Наполеона в Отечественную войну 1812 года школу эвакуировали сначала во Владимир, а оттуда в Кострому и далее в Плёс.
Когда школа вернулась в Москву, она долгое время не имела собственного здания. Поэтому приобретение для неё дирекцией императорских театров в 1856 году бывшего здания учебного заведения кантонистов по улице Пушечная, 4 стало ярким событием в жизни этого учебного заведения. В 1863 году специально для перестройки здания под расположение в нём Театрального училища был приглашён архитектор С.А. Ползиков. Он в соответствии с проектом главного архитектора императорских театров России Альберта Коваса полностью перестроил здание. Сейчас здесь расположено Высшее театральное училище имени М.С. Щепкина. Охранная доска, установленная на его фасаде в 1992 году, свидетельствует о том, что этот дом является уникальным историко-архитектурным памятником XIX века. Надворные флигели училища были перестроены в 1899-1902 годах, чтобы училище могло расшириться. Старые корпуса, располагавшиеся на улицах Неглинная и Софийка, были переделаны, у воспитанников появилась возможность прогуливаться в получившемся внутреннем замкнутом дворике.
Церковь Марии Магдалины устроили на четвёртом этаже надворного флигеля. После её освящения весной 1903 года старостой церкви был назначен А.А. Бахрушин. С 1910 года на время был прекращён приём воспитанников в драматические классы, работали только балетные.
Во время Первой мировой войны в здании располагался военный госпиталь. Домовая церковь школы тогда выполняла своё духовное предназначение для раненых солдат. Но с наступлением советского периода в жизни страны время Императорской театральной школы закончилось. В рамках антирелигиозной пропаганды церковь была закрыта в 1920 году, а церковная утварь и всё её имущество были переданы в церковь Знамения, которая располагалась в Переяславской слободе.