Современное здание на углу Пятницкой улицы и Вишняковского переулка (Пятницкая, 51) построено в несколько этапов в 1804—1811, 1815—1824, 1826 гг.; ограда и здания причта — 1830-х гг. Памятник архитектуры позднего ампира/классицизма. Первая церковь на этом месте выстроена, вероятно, в 1630-е гг. в связи с заселением южных окраин города стрельцами, прикрывавшими оборонительную линию Земляного вала. Первое документальное свидетельство о новой церкви «Троицы в Алексееве приказе Мещеринове», по имени стрелецкого полковника, датировано 1642; в 1657 г., со сменой полковника, её называли «Троицы в Стрелецкой слободе в Ивановом приказе Монастырёве». Позднейшее название «Вешняки» или «Вишняки» также связано со стрелецким командиром Матвеем Вишняковым.
Первый каменный храм был выстроен в память Битвы под Чигириным; разрешение на постройку было получено в 1678 г., но началась она не ранее 1686 г. Этот храм расширялся приделами в 1706, 1734, 1788 гг. Колокольня была вынесена на красную линию Пятницкой улицы, которая была значительно уже, чем сегодня. В 1804 началась последовательная замена построек старого храма — на новые. В 1804 г. вновь выстроили трапезную, тогда же заложили новый основной, однокупольный объём церкви, вчерне законченный к началу войны 1812 г. Во время пожара 1812 г. храм горел и был восстановлен вчерне в 1815 г., полностью — к 1824 г. В 1826 г. Пятницкую улицу расширили, а старую колокольню, мешавшую проезду, снесли; новую выстроили по проекту Ф.М. Шестакова и Н.И. Козловского. Ограда и дома причта были закончены к 1838 г. На стрелке Пятницкой и Вишняковского переулка ограду завершала угловая одноэтажная ротонда (купеческая лавка при церкви; утрачена). Сама же церковь во времена, когда Замоскворечье было деревянным, была крупнейшей градостроительной вертикалью Пятницкой части. Широко распространено, но не подтверждается академическими источниками мнение об авторстве А.Г. Григорьева. Церковь была закрыта не ранее 1929 г., вновь открыта в 1994 г.