Монастырь основали в 1249 году, а закрыли в 1629. В 1631 там уже открыли гимназию. Принадлежащая к этому комплексу церковь была до 1716 года шведской церковью Св. Михаила, а после этого стала православной церковью Преображения Господня. Иконостас датируется 1720 г., выполнен Иваном Зарудным. Башня в стиле барокко построена в 1776 г. Самые крупные работы с внешними стенами церкви были проведены в 1827-30, когда церковь получила вид в стиле классицизма. После постройки Собора Александра Невского церковь стала принадлежать эстонской православной общине.

Информация получена от Дмитрия Сазанова

Бывший женский цистерцианский монастырь св. Михаила (основан в 1249 датским королём Эриком IV Вальдемарссоном Плуфпеннингом (1216–28/III-1241–10/VIII-1250).

Легенда говорит, что однажды королю явился Христос, будто бы только что сошедший с креста, весь израненный и в крови. Король испугался, и спросил, кто распял Христа во второй раз. И сказал Христос, что распят он из-за многочисленных грехов короля. И что искупить он их сможет, только если построит женский монастырь в честь св. Михаила в том месте своей державы, где в середине лета на расстоянии полёта стрелы по щиколотку лежит снег… Монастырь закрыт в ходе реформации в 1540-ые гг. В 1631 г. шведский король Густав II Адольф открыл в стенах бывшего монастыря гимназию. После занятия города русскими войсками (1710) в 1719 монастырская церковь переоборудована в православный гарнизонный храм в честь Преображения Господня. В 1776 г. появляется башня с барочным завершением. В 1828–1832 арх. И.Д. Бантельманн возводит барабан с куполом.

Сейчас церковь принадлежит Автономной Эстонской Православной Церкви Константинопольского патриархата.

Церковь находится в Старом (Нижнем) городе рядом с крепостной стеной. Это каменная постройка в стиле классицизма с круглыми окнами, куполом с барабаном и башней, увенчанной барочным кивером. В интерьере присутствуют элементы поздней готики. К ним, в частности относятся крестовые своды, опирающиеся на массивные 12-гранные столбы, и балкон для монахинь.

Первоначально на месте церкви находилась часовня Святого Вячеслава (Вацлава), построенная предположительно в 1219 года. После основания в 1249 году женского цистерцианского монастыря Святого Михаила она использовалась в качестве его церкви. В последней трети XIV века (по др. данным, в первой половине XV) часовню расширили и перестроили в двухнефную церковь.После секуляризации монастыря (1629) церковь в 1631 году передали шведскому гарнизону, который пользовался ею до капитуляции Ревеля в 1710 году. Выполняя распоряжение Петра I, эстляндский генерал-губернатор А.Д. Меншиков потребовал передать её русскому гарнизону Ревеля и 14/25 февраля 1716 года магистрат удовлетворил это требование. Эстляндский гарнизонный полк поместил в ней свой полковой образ св. Феодора Стратилата, в связи с этим до 1734 года храм назывался церковью св. Феодора.

В 1719 году по распоряжению Петра I И.П. Зарудный изготовил для неё новый иконостас, который в 1732 году установили в церкви. Пётр посещал богослужения в этой церкви, в частности в мае 1721 года. Из Юрнала Петра I за 1721 год: «Май <...> 27-го <...>. приехала Государыня Царица <...> пополудни в 7-м часу, и потом слушали всенощную в городе в церкви Св. Феодора Стратилата и вышли из церкви в 12-м часу пополудни».

По указу царя 1725 года, церковь была частично перестроена М. Молчановым и приспособлена для православного богослужения. Освящение перестроенной церкви состоялось 12/23.11.1732 года. В 1734 её передали православным жителям Ревеля в качестве приходской церкви, и она стала именоваться Соборной церковью Преображения Господня. В 1736 году в ней венчались А.П. Ганнибал с Х.М. Шёберг

Автор Андреева Н.С.  http://spp.lfond.spb.ru/europe/memorials/303

Вероятно, это здание изначально было часовней, построенной в 1219 году в честь победы датчан в битве, которая, как гласит легенда, дала им государственный флаг Даннеброг, якобы подаренный Небесами.

Поблизости был построен один из двух средневековых женских монастырей – монастырская церковь ордена цистерцианок, посвященная Св. Михаилу. После Реформации монастырь просуществовал около века и, в конечном итоге, в 1629 году был закрыт. Впоследствии церковные помещения использовались первой эстонской гимназией (сегодня известна как Гимназия Густава-Адольфа), первой типографией в Таллинне, которая позже использовалась как шведский гарнизон. Затем уже русский гарнизон был реконструирован, и на его месте в 1732 году появился Собор Преображения Господня (архитектор А. Мельников).

Нынешний шпиль, а также купол в форме шлема в стиле барокко, были добавлены в 1776 году. Старейший колокол Таллина Маттиас Бенинк также разместился в этой церкви после того, как в 2002 году пожаром был разрушен колокол Церкви Святого Духа.