Недалеко от собора была построена деревянная церковь в честь сошествия Святого Духа. Со временем деревянный храм был разобран, и на его фундаменте построили каменный двухэтажный храм с нижним престолом в честь Рождества Христова и верхним – в честь апостола Андрея Первозванного. После реконструкции 1868 г. храм стал одноэтажным, с престолом во имя Живоначальной Троицы. В 1885 г. церковь была украшена предалтарным плафоном с изображением Божией Матери, сидящей на престоле с Предвечным Младенцем на руках и окруженной Ангелами.

В годы своего расцвета монастырь имел высокий статус лавры. Сохранились очерки монастырского устава. Духовным ориентиром обители были поучения преподобного Кассиана Римлянина. По инициативе Иоиля (Труцевича) была создана иконописная мастерская, работала мастерская по переписыванию и переплету книг, где трудились талантливые художники, резчики по дереву, чеканщики, граверы.

Новая история обители началась с 1990 г., когда была зарегистрирована приходская община. С 1992 г. монастырь стал действующим. Государственную регистрацию получил 7 апреля 1993 г. При содействии государства в 1995 г. был отреставрирован Свято-Троицкий храм. В начале 2010 г. в восточной части монастырского корпуса построена крещальня. 10 октября 2014 г. в обитель была перенесена местночтимая Оршанская икона Божьей Матери (день памяти 5/18 сентября и 20 июля/2 августа), временно находившаяся в Свято-Успенском женском монастыре города Орши.

http://monasterium.by/monastyri-belorusskoy-pravoslavnoy-tserkvi/vitebskaya_eparkhiya/svyato-bogoyavlenskiy-kuteinskiy-muzhskoy-monastyr-g-orsha/

Вторым храмом на территории Кутеинского мужского Богоявленского монастыря была Свято-Духовская церковь, строительство которой также осуществлено в XVII веке (1624-1626 гг.). Свято-Троицкая (Свято-Духовская) церковь, ныне действующая, является теплым храмом монастыря. Изначально храм был деревянный, затем на его фундаменте построили каменный двухэтажный храм с нижним престолом в честь Рождества Христова и верхним – в честь апостола Андрея Первозванного. После реконструкции в 1868 г. храм стал одноэтажным, с престолом во имя Живоначальной Троицы (Свято-Троицкая церковь переосвящена из бывшего Святодуховского храма). В 1885 г. церковь была украшена предалтарным плафоном с изображением Божией Матери, сидящей на престоле с Предвечным Младенцем на руках и окруженной ангелами.

Храм существовал до 20-х годов ХХ века. В 1920 году был закрыт последний Троицкий храм (Свято-Духовской) Кутеинского монастыря. Настоятель храма игумен Ферапонт (Отрощенко) переведен в Покровскую церковь д. Ланенка Дубровенского района. Спустя десятилетия, монастырский храм потерял первозданный архитектурный облик. Троицкая церковь была изуродована до неузнаваемости, венчания сбиты. В 30-х годах XX века в стенах обители размещались войска РККА. Во время Великой Отечественной войны на территории монастыря располагался лагерь для советских военнопленных. В 70-х годах XX века на территории монастыря размещалась автошкола ДОСААФ. 

Решением Витебского облисполкома от 16 июля 1976 года сохранившиеся исторические памятники архитектуры, в том числе и Троицкий собор обители, взяты под охрану государства. Лишь в 1995 году Свято-Троицкий храм Кутеинского монастыря был отреставрирован. Единственный сохранившийся в обители Троицкий собор, после проведённой реставрации, признанной специалистами неудачной, стал действующим.

В последние годы специалисты и архитекторы довольно часто стали высказываться о том, что ценнейшему памятнику архитектуры республики Беларусь необходима новая реконструкция этого храма в традициях православной средневековой архитектуры, на основании имеющихся исторических и научно-исследовательских данных.

С сайта: https://www.souzveche.ru/articles/community/21409/12 сентября 2013/Неугасимый свет Кутеинской лавры/