Силоамский источник выбивается в Гефсиманском саду у подножия монастырского холма, в 30 м к западу от Иноплеменничьей башни. Название источника связывано со знаменитой Силоамской купелью, находящаяся у подножия горы Сион, на юго-восточной окраине древнего Иерусалима. По преданию, в V веке до нашей эры, во время осады Иерусалима, пророк Исайя помолившись извел из-под горы Сион источник воды, который был назван Силоам, т. е. «посланный от Бога».
Над Силоамским источником в Новом Иерусалиме находилась деревянная часовня, именуемая «Силоамская купель». Она была построена в 1845 году плотничным мастером Никитой Алексеевым, крестьянином из Покровского уезда Владимирской губернии. Ежегодно в праздник Преполовения Пятидесятницы из Воскресенского монастыря к Силоамской купели совершался крестный ход для освящения воды. Внутри часовни был каменный колодец, по стенам висели иконы, перед которыми стояли подсвечники. По краю колодца висели металлические ковши с длинными, загнутыми на конце ручками. Воду для паломников черпал и разливал монах, несший послушание в часовне.
Силоамская часовня была разрушена в 1930-х годах. Однако источник уничтожить не удалось, хотя по приказу местных властей родник засыпали землёй и песоком.
Первое после возобновления Воскресенского монастыря освящение Силоамского источника было совершено в Крещенский сочельник 18 января 1994 года. С тех пор освящение воды в источнике совершается ежегодно в праздник Богоявления Господня. Над святым источником поставлен поклонный крест, часовня пока не воссоздана.