Шатровая однопрестольная церковь святителя Иннокентия Иркутского была построена из кедрового леса бригадой китайских плотников на пожертвование купца 1-ой гильдии Иннокентия Михайловича Сибирякова в 1899 году.

Храм был освящён в честь особо почитаемого Шмаковскими иноками святителя Иннокентия - небесного покровителя всей Сибири. Храм имел в плане форму креста и был завершён 12-ю главами. Над притвором была поставлена 3-х главая звонница. Алтарь храма был просторным и светлым. Слева к алтарю примыкала пономарня, справа - ризница. Двухъярусный иконостас был выполнен монастырской братией. В первом ярусе помещались иконы, писанные в Санкт-Петербургской мастерской Сидорского; иконы второго яруса были выполнены в Валаамском Спасо-Преображенском монастыре. Очень удачно было выбрано место для его постройки. Храм поставили на северо-западном склоне Преображенской сопки. Он очень хорошо смотрелся с основной территории монастыря.

В 1902 году в непосредственной близости от храма, к северу от его алтаря была построена деревянная часовня в честь Казанской иконы Божией Матери в память восшествия на престол императора Николая II.

В годы Гражданской войны храм Иннокентия Иркутского и рядом стоящая Казанская часовня сгорели. В начале 2000-х годов на их месте братией возрождённого Троицкого Николаевского Уссурийского монастыря был поставлен поклонный крест. К нему спускается лестница от Спасо-Преображенского храма.

Храм имеет форму креста, 12 куполов, с золоченым красивым крестом на одном главном куполе; построен из кедрового леса в 1899 году китайцами-рабочими, так как русских мастеров для постройки церквей в крае нет. Рассчитан на 360 молящихся. Деньги на постройку этого храма были пожертвованы известным иркутским миллионером Иннокентием Михайловичем Сибиряковым, скончавшимся на Афоне в сане схимонаха. Престол в храме один, в честь Небесного Покровителя всей Сибири Святителя Иннокентия, первого Епископа Иркутского, Чудотворца. Имеются частицы Животворящаго древа Креста Господня, 31 частица святых мощей разных угодников Божиих и икона Св.Троицы, писанная на Афоне на сучке Мамврийскаго Дуба.

Частицы Св.угодников Божиих следущие: 1) муч. Мины, 2) Великом. Целит. Пантелеимона, 3) Великом. Георгия, 4) муч. Ермолая, 5) благов. и равноапост. Царя Константина, 6) м-цы Фотины Самаряныни, 7) муч. Трифона, 8) В-муч. Меркурия, 9) В-цы Параскевы, 10) В-цы Марины (все десять святынь дар келии Св. Иоанна Златоуста), 11) Св. Иоанна Милостиваго, 12) муч. Ермолая, 13) безсребр. Космы, 14) безсребр. Дамиана, 15) В-муч и целит. Пантелеимона (все пять святынь дар от русскаго на Афоне монастыря Св.Великомуч. и целителя Пантелеимона), 16) муч. Меркурия (дар Хиландарской лавры), 17) Св. Апостола Иакова, брата Господня, 18) Никифора, патриарха Царьградскаго, 19) В-ка Трифона, 20) муч. Севастиана, 21) муч. Каллиопия, 22) Препод.-муч. Евфимия Афонскаго, 23) Пр. муч. Акакия Афонскаго, 24) Пр. муч. Игнатия Афонскаго (все восемь святынь дар св. Андреевскаго Скита), 25) Св. Ап. Андрея Первозваннаго, 26) В-ка и цел. Пантелеимона, 27) В-ка Харалампия, 28) В-цы Варвары, 29) Василия Великаго, 30) Иоанна Златоустаго и 31) Преподобн. Феодосия Великаго, общих житий начальника. Ризницу монастыря назвать вполне достаточною нельзя, так как при служении большим собором, особенно в приезд Преосвященнаго, одинаковых священнических облачений далеко не хватает.

http://www.monast.ru/history/