После Второй мировой войны территория бывшего Спасского храма использовалась для нужд города. Здесь были построены кафе и столовая, просуществовавшие до начала 1980-х гг. Позже эти постройки были снесены, а на их месте ненадолго возник парк. Решение о восстановлении собора было принято в начале 1990-х гг. Эту инициативу поддержали местные жители, казаки и священнослужители. 1 августа 1992 года состоялось освящение места строительства и установлен крест. Строительство благословил митрополит Гедеон, работами руководила команда инженеров под руководством А. Занина. Первый этап предполагал поиск фундаментов первого Спасского храма. Они были обретены в 2003 г., что позволило разработать более подробный проект нового собора, взяв за образец архивные фотографии и первоначальный проект Константина Тона.
В 2005 году начались строительные работы. В 2011 году была воссоздана Пятигорская архиерейская кафедра. И восстановление собора, ставшего главным храмом Пятигорской и Черкесской епархии ускорилось. Собор был освящён Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом 14 декабря 2012 года. Патриаршим указом собор приобрёл статус кафедрального.
Нерешенным оставался вопрос о возвращении Иверского образа Божией Матери, который находился в Лазаревском храме г. Пятигорска. Около года ждали, пока на горе Афон напишут новый образ. В Спасский собор икона была перенесена через два года и заняла свое нынешнее место. Один из престолов собора освящен в честь этой иконы. Образ освятили вместе с иконой Божьей Матери "Всецарица", которую также написали в Ватопедском монастыре горы Афон. Икону эту почитают как хранительницу от многих болезней, в том числе и от смертельных. Прихожане же считают, что пребывание двух чудодейственных образов в Спасском храме непременно положительно повлияет и на Пятигорск, и на судьбы его обитателей.
Источники информации: http://pyatigorsk-1.cerkov.ru/
http://lions-guides.ru/Stavropol-territory/sights-of-Pyatigorsk/Spassky-Cathedral