Одноглавая тёплая Спасо-Преображенская церковь Борисовской женской пустыни была построена не позднее 1719 года. Ее сменил каменный храм, построенный в 1831-1834 годах и расширенный в 1846 году. В 1848 году в храме был сооружен придел во имя святителей Григория Богослова, Василия Великого и Иоанна Златоуста. В 1859 году храм, переставший вмещать насельниц, был снесён, и на его месте в 1861-1862 годах была построена и освящена новая пятиглавая церковь с 3-ярусной колокольней. Храм был закрыт в 1923 г. вместе со всеми храмами обители и впоследствии взорван.