Строительство храма было начато в декабре 2004 года. Автор проекта здания — С.Н. Малюк, уроженец станицы Динской Краснодарского края. Храм расположен на исторической окраине Кореновска, выполнен в старорусском стиле. Белоснежный, увенчанный семью золотыми куполами — по числу церковных таинств.
Храм стоит на «монолитной подушке», приподнятый на два метра от уровня земли. Задумывалось, что здесь будет единственный во всем районе баптистерий — место для погружения в воду при Крещении взрослых. До революции в станице Кореновской было два храма: во имя Святого Саввы Освященного, сохранившийся еще со времени Запорожской Сечи и построенный в 1883 году храм Успения Пресвятой Богородицы.
Многие священнослужители этих храмов окормляли население станиц по нескольку десятков лет. Трагическая судьба в те годы ожидала одного из самых авторитетных в то время священников станицы Кореновской о. Петра Назаренко. Он известен как священник Саввинской церкви еще с 1885 года, а обязанности псаломщика в то время исполнял Матвей Говорусский. По свидетельству старожилов, Назаренко был зверски замучен активистами новой власти, что подтверждает книга «Очерки истории Кубани. ХХ век». Изд. ОКПЦ «Перспектива образования», изданная в Краснодаре в 1998 году: «В станице Кореновской был убит священник Назаренко, а в храме произведены глумления: алтарь обращен в отхожее место, для чего использовались священные сосуды». В тот же самый день, 25 октября, застрелили в Ставрополе старейшего заштатного священника станицы Кореновской о. Павла Калиновского, ему был 71 год.
Комиссией по канонизации причислены к лику Святых Новомучеников Кубанских священники: Андрей Филиппович Ковалев, родившийся в станице Кореновской, Григорий Иосифович Троицкий, Иоан Иоанович Яковлев, Михаил Лекторовский, Григорий Яковлевич Конокотин. Это были известные и заслуженные священники, имевшие духовные и светские награды. Все они были приговорены к расстрелу в сентябре 1921 года. Определением Священного Синода ныне их имена включены в Собор новомучеников и исповедников российских.
В память о тех трагических событиях и о жертвах, понесенных Православной Церковью в те годы, в городе возведен храм во имя Новомучеников Кубанских, который при большом стечении народа был освящен Митрополитом Екатеринодарским и Кубанским Высокопреосвященнейшим Исидором.