24 июня 1821 года заложен каменный храм, протоиереем Градо-Екатеринбургской Богоявленской церкви Николаем Вологодским, по благословенной грамоте от 2 февраля 1821 года за №495-м, данной Преосвященнейшим Иустином, епископом Пермским и Екатеринбургским. 3 июня 1837 года достроенный каменный храм освящен Преосвященнейшим Евлампием, епископом Екатеринбургским во имя Знамения Божией Матери. Первоначально в каменном храме было два придела: во имя Иоанна Предтечи и в честь иконы Знамение Божией Матери. В 1858 году придел во имя Иоанна Предтечи был упразднен из-за маловместительности, а на месте престола в 1861 году устроено мраморное возвышение в две ступени, обнесенное железной решеткой, здесь до революции находилась плащаница. Храм строился на иждивение прихожан и с помощью заводоуправления Сысертских заводов.
Иконостас в каменном храме был четырехставный, столярной работы, с золоченой резьбой. В ноябре 1893 года иконостас окрашен синей краской, позолота вычищена и иконы вымыты, Екатеринбургским мещанином Александровым, в том же году стены храма покрыты живописью монахинями Екатеринб. женского монастыря. Вокруг храма, описывает в 1901 году священник Ключарев, ограда каменная с железными решетками и мраморными столбами, устроена прихожанами с. Щелкуна. В храме была местно-чтимая икона Божьей Матери Одигитрии (Путеводительницы), она была обложена фольговой ризой, унизанной топазами. Из древних вещей в Щелкунской церкви хранилось бывшее напрестольное Евангелие, напечатанное в Петербурге в 1711 году. 18 октября 1898 года при храме открыто церковно-приходское Попечительство. При храме была библиотека.
По данным протоиерея Валерия Лавринова, в 1935 году в Щелкунской церкви запретили звонить в колокола, а в 1936 году она была закрыта и перестроена. В «Летописи Уральских деревень» написано, что после революции церковь работала до 1938 года, колокола сняли и увезли раньше, главный колокол находится сейчас в краеведческом музее г. Екатеринбурга. После закрытия в церкви образовали склад. В конце 1950-х годов стали искать место под школу и решили снести церковь, коммунистка К. Черноголова ходила и собирала подписи на снос церкви. По объявлению набрали рабочих из Щелкуна, Новоипатова, Верхней Боевки. Долго рубили крест, он был откован из 60-миллиметрового железа. Запомнилось, как раскапывали могилы священнослужителей в церковной ограде. Это записано со слов Марии и Феклоньи Вольхиных и Евдокии Чернавских ученицей 10 класса.
По материалам статьи «История храма села Щелкун» на сайте Сысерть.онлайн/сысертский-район/история-села/история-храма-села-щелкун