Первая церковь на Баботозёрском погосте появилась не позднее начала XVII века. Вполне вероятно, что она была построена ещё в конце XVI столетия, когда волость перешла во владение Кирилло-Белозерского монастыря. В переписной книге Белозерского уезда и Чарондской округи конца XVII века, описываются две деревянные церкви: «Церковь Господня Стретения, другая святого Николая Чюдотворца в Белозерском уезде, Кирилова м[онастыря] в вотчине, в селе Бабоозере. Служит поп Стефан Федоров, детей у нево 1 сын Наум, грамоте учен. В приходе, по иво скаске, 33 д.[вора]». В переписной книге Белозерского уезда 1710 года упоминаются те же церкви: «Тогож Кирилова монастыря вотчина Село Баботоозеро. На погосте церковь Сретения Господня церковь Николая Чюдотворца … В том же селе Двор монастырской в нем жили преж сего прикащики погодно. В деревне Васильевской во дворе крестьянин …»

В 1816 году вместо ветхих деревянных храмов была построена каменная церковь в честь Сретения Господня с приделом во имя святителя Николая Мирликийского. Классический восьмерик на четверике, в стиле провинциального барокко, характерный для белозерских храмов XVIII века, увенчанный восьмигранным куполом с маленькой главкой на невысоком круглом барабане. С восточной стороны к основному объёму храма примыкала пятиугольная алтарная апсида. С запада была пристроена трапезная, на южной стороне которой располагался тёплый Никольский придел. Трёхъярусную колокольню венчал четырёхгранный купол с высоким шпилем, установленным на небольшом барабане.

Согласно списку населённых мест Новгородской губернии за 1912 год, при Сретенской церкви существовала церковно-приходская школа и фельдшерский пункт. Священниками Сретенской Баботозёрской церкви во второй половине XIX -  начале XX вв. числились Павел Иванович Юрьев (1864 г.) и Василий Образцов (1900 г.)

Закрыта церковь, вероятнее всего, в 30-х годах прошлого столетия. Здание храма использовалось под хозяйственные нужды, в 1960-х годах в нём хранили колхозное сено. В настоящее время храм заброшен и постепенно разрушается.

https://vk.com/wall42162710_3116