Основана в память спасения императора Александра III и его семьи во время железнодорожной катастрофы под станцией Борки 17 октября 1888 года. Церковь была освящена 6 декабря 1889 г. Устроена церковь усердием и на средства потомственного почетного гражданина Г.И. Шушпанова. Во время Великой Отечественной войны здание бывшей гимназии сгорело. На месте здания бывшей мужской гимназии построено новое для школы № 43.
Малаховский Е.И. Храмы Ростова-на-Дону.