В 1844 году в обители начинается строительство храма в честь Всех Святых. Игумен Венедикт подаёт прошение митрополиту Московскому и Коломенскому Филарету о построении на западной стороне ограды каменного двухэтажного корпуса братских келий, по той причине, что: "в оной Николаевской Берлюковской пустыни не достает братских келий и некоторые живут по двое; почему и необходимо нужно выстроить вновь каменный корпус длиной 16 сажень и шириной 17 сажень". Причём в прошении игумен Венедикт просит устроить этот корпус вместе с домовым храмом, и на месте, очень значимом для обители, там, где прежде находилась монастырская хлебная, в которой был обретён чудотворный образ "Лобзание Иисуса Христа Иудою".
Замысел о. Венедикта состоял в том: "... чтобы при келиях, на самом том месте, где прежняя старая братская деревянная трапеза с пекарнею, пришедшея в совершенную ветхость, ничем не занимаемая и в которой прославилась чудесами Икона Христа Спасителя, в память сего благодатного события, устроена была церковь во имя Всех Святых, и как в настоящее время, по заведению, исправляется в ветхой пекарне ежедневное чтение Псалтири по усопшим вкладчикам, то и в предлагаемом в келиях сего корпуса поместить престарелую болящую братию, а в церкви, которая по сему прилично может именоваться больничною. На будущее время, сверх богослужения, будет совершаться и ежедневной чтение Псалтири нерушимо". Отсюда мы можем сделать вывод, что деревянная трапезная с пекарней, в которой была обретена икона "Лобзание Иисуса Христа Иудою" просуществовала до 1844 года на прежнем своём месте.
В апреле 1845 года последовал Высочайший Указ, гласивший: "Построение каменного корпуса с больничною при нем церковью во имя Всех Святых на монастырскую сумму для келий болящей братии, по недостатку братских келий, признать необходимым". Храм был заложен на западной стороне монастырской ограды. С двух сторон к храму примыкали двухэтажные каменные корпуса: правый корпус - настоятельский, в левом - больница и аптека. Это был как бы домовый храм, службы для прихожан и паломников в нём не проводились. Храм был очень интересно продуман. Устроено всё было таким образом, что из палат больницы, примыкавших к храму, больные, лёжа на кроватях, могли принимать участие в богослужении. Для этого, напротив каждой кровати было прорезано окно, через которое, не вставая, больная и престарелая братия могла наблюдать службу в самом храме. Этот храм всегда поддерживался коштом жителей сёл Купавны и Кудиново. Это и понятно: из Кудиново была родом Татьяна Ивановна Кузнецова, первая исцелившаяся у чудотворного образа, из Купавны - фабрикант Пётр Семёнович Бабкин, который 7 сентября 1836 года после молебна перед чудотворным образом Христа Спасителя на своей фабрике в селе Купавна исцелился от тяжёлой формы горячки. Это новое исцеление всколыхнуло тогда всю округу.
Сама церковь была: "каменная, одноглавая, с шатрообразным куполом и с хорами, на кои ход из настоятельских келий; в ней иконостас двухъярусный, покрытый тюлем и вызолоченный на полимент с резьбой...". Церковь была окрашена светло-зелёной и белой краской на масле. Владыка Филарет благословил: "снаружи на стене на том месте, где явился Чудотворный Образ Христа Спасителя написать в точную меру Явленного и сделать киот для поклонения всякому проходящему в монастырь". Благословение митрополита Филарета было выполнено. Под образом была сделана краткая надпись о чуде обретения. Внутри храм был богато украшен, в нём пребывало 50 икон, а также "... хоругви для выноса во время крестных ходов, иконы Воскресения Христова, Богоявления, Святой Троицы и Лобзания".
В церкви находился замечательный иконостас, весь резной и вызолоченный по тюлю, работы мастера Павла Константинова, проживающего в селе Купавне. Ктитором храма во имя Всех Святых выступил московский купец Фёдор Фёдорович Набилков. На строительство он пожертвовал 10 000 рублей, продолжал делать пожертвования и позже, в процессе строительства храма. Спустя некоторое время Фёдор Фёдорович Набилков передаёт обители ещё 1000 рублей серебром и 5000 рублей на отделку храма и установку иконостаса. 29 июня 1853 года эта церковь была освящена митрополитом Московским и Коломенским Филаретом. С момента разорения монастыря в 1920-е годы, на его территории размещался дом инвалидов общего профиля, в годы Великой Отечественной войны здесь создаётся госпиталь на 100 мест, позже вновь реорганизованный - в дом инвалидов войны. С 1972 года на территории монастыря размещается больница №16 Департамента здравоохранения города Москвы. Церковь в честь Всех Святых с больничными покоями одной из последних была передана в ведение РПЦ.
Из книги: А. Панин, И. Григорьева, В. Дмитриев "История Николаевской Берлюковской пустыни". - "Берлюковский Издательский Дом", 2011