Первое упоминание о Козине восходит ко времени игуменства преподобного Саввы Сторожевского. Село было приписано к монастырю, и, надо полагать, церковь в нем существовала еще до XV в. Во время войны 1812 г. деревянный храм сгорел. В 1813 г. на его месте возведена каменная Троицкая церковь, просуществовавшая до 1934 г. В годы сталинского террора церковь была полностью разграблена и разобрана вплоть до фундамента. Архивные данные о судьбе духовенства не найдены.
Церковная община возрождена в 1998 г. В 1999 г. выстроена и освящена архиерейским чином малая кирпичная церковь в честь святителя Иоанна Златоуста. Уцелевшая при разграблении церкви, чтимая до революции икона Божией Матери "Умиление" (Кикская), ныне находится в Звенигороде в храме Успения Пресвятой Богородицы на Горке. В 2002 г. начато строительство деревянного Троицкого храма по проекту архитектора П. Паршикова. На церковной территории предполагается строительство приходского здания, в котором должны расположиться воскресная школа и медицинский консультативно-диагностический центр.
В храме находятся частицы мощей: святого апостола Андрея Первозванного, священномученика Игнатия Богоносца, святителя Василия Великого, святителя Иоанна Златоуста, святителя Феофана Затворника Вышенского, священномученика Петра (Зверева), святителя Лаврентия епископа Туровского, великомученика Георгия Победоносца, великомученика Пантелеимона, мученика Иоанна Воина, святого праведного Иоанна Русского, святой благоверной княгини Анны Кашинской. В дни их памяти, а также в дни памяти преподобного Саввы Сторожевского совершаются праздничные богослужения.