По преданию, село названо по имени дочери владельца этих земель Ивана Хлопова - Марьи, неудачной невесты царя Михаила Фёдоровича, которую под предлогом неизлечимой болезни сослали вместе с родными в Тобольск, а оттуда в Верхотурье, позже в Нижний Новгород. Владения перешли к Бутурлиным как приданое Анны Васильевны Хлоповой, вышедшей замуж за Дмитрия Ивановича Бутурлина. В 1748 году новый владелец земель - Дмитрий Иванович Бутурлин - построил ныне существующую белокаменную трёхпрестольную церковь в честь Воздвижения Креста Господня. В церкви были устроены три придела: центральный - в честь Воздвижения Креста Господня, правый - в честь Архистратига Михаила, левый - в честь апостолов Петра и Павла. Последующий владелец, Пётр Михайлович Бутурлин возвёл большую четырёхъярусную в стиле ампир, колокольню, не соответствующую стилю маленькой церкви, его же отец построил сохранившиеся до наших дней оригинальные конный двор и службы. Вероятно, автором проекта конного двора был знаменитый русский зодчий В. И. Баженов. До 1802 года Марьинская церковь была приписана к Преображенской деревянной церкви села Заворина, которая находилась в 1.5 верстах от церкви на запад, на реке Северке. Существует предание, что монастырь был основан на месте, где простился с благоверным князем Димитрием Донским преподобный Сергий Радонежский, провожавший князя.
В ХVIII веке монастырь был закрыт, монахов перевели по другим обителям, а деревянный храм получил статус приходской церкви (уничтожена в советское время). После 1802 года Преображенская церковь была приписана к Марьинскому храму. В 1895 году Крестовоздвиженская церковь усилиями настоятеля, священника Николая Боголепова была отремонтирована. Его стараниями в 1891 году построено новое здание церковно-приходской школы.
В советское время Марьинский храм не избежал разграбления, закрытия и осквернения. После 1930-х годов здесь в разные годы размещались цех конфетной фабрики, прачечная, склад пионерского лагеря швейной фабрики "Заря". Со временем, при ненадлежащей эксплуатации, обрушился свод южного придела, появились повреждения в интерьере и самой конструкции здания, обусловленные нецелевой эксплуатацией здания в советское время.
Когда храм в середине 1990-х годов передали РПЦ, то обнаружились следы ранней неравномерной осадки, возникшей при строительстве колокольни. 20 сентября 2016 года на Управляющем совете Благотворительного Фонда Московской епархии по восстановлению порушенных святынь рассмотрена и принята в работу заявка от настоятеля Крестовоздвиженской церкви на разработку проекта реставрации храма села Марьинки. Началась долгая и кропотливая реставрация, спасшая от разрушения это уникальный памятник архитектуры Ступинской земли. За время восстановительных работ был проведён полный комплекс реставрационных и противоаварийных работ: проведено укрепление фундамента и реставрация цоколя, восстановление кирпичных и белокаменных стен храма; воссозданы карнизы приделов и кирпичный свод церкви, белокаменные полы, проведена окраска стен фасада колокольни и притворов; воссозданы завершения храма - барабан с шатриком, шаром и крестом, купола, тумбы и шпиль колокольни.
28 сентября 2019 года епископ Серпуховский Роман в сослужении духовенства Московской епархии совершил Великое освящение Крестовоздвиженского храма, восстановленного по программе Благотворительного фонда Московской епархии по восстановлению порушенных святынь.
С сайта: www.sohranihram.ru/Крестовоздвиженский храм с. Марьинка