В Великом Новгороде церковь Святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова была заложена в 1383 г., непосредственно за кольцом Окольного города, в урочище Радоковицы, у места, где в прошлом в Волхов впадала маленькая речка Витка. Храм был освящён в 1384 г. как главный храм небольшого и небогатого женского монастыря, основанного новгородским архиепископом Моисеем на правом берегу реки Волхов.
Здание церкви имеет характерные черты новгородского зодчества второй половины XIV в. и представляет собой трёхнефную, одноапсидную, однокупольную прямоугольную постройку с несколькими каменными закладными крестами в стенах и композицией из трёх окон с двумя узкими нишами между ними над древним порталом. Подобная композиция имеется также на фасаде церкви Спаса на Ильине улице и на фасаде церкви Петра и Павла в Кожевниках.
В древности фасады храма имели трёхлопастные завершения, позже были заменены щипцами, по которым была положена восьмискатная кровля. В XVI в. с запада был пристроен каменный притвор с тёплым Успенским приделом, на фундаменте которого в XVII в. была сооружена пристройка с небольшой звонницей.
Богословский монастырь был упразднён в 1764 г. и храм действовал как приходской.
В 1799 г. к церкви была пристроена невысокая колокольня в стиле классицизма.
В середине 1920-х г.г. церковь была закрыта, помещения церкви использовались как склад располагающейся рядом лодочной станции.
В годы Великой Отечественной войны храм серьезно пострадал. В аварийном состоянии был угол храма, который грозил обрушением, в 1946 г. он был временно укреплен с помощью системы бревенчатых подпор, а в 1952 г. его впервые реставрировали, но не использовали и храм тихо ветшал и разрушался. Стала протекать кровля, потрескались своды и стены - в таком плачевном состоянии в 2001 г. храм был передан общине Русской Православной Старообрядческой Церкви Великого Новгорода, после чего началось его восстановление.
Cоздание общины РПСЦ в Великом Новгороде началось в 2000 г., после посещения города митрополитом Московским и всея Руси Алимпием. Побывав здесь и встретившись с живущими в городе старообрядцами, он в следующем 2001 г. направил сюда уставщика Александра Панкратова с благословением организовать приход и открыть храм. За этим последовали годы неустанных трудов старообрядческой общины.
После праздника Всех Святых 2004 г. Великий Новгород посетил митрополит Андриан и принял решение о диаконской хиротонии уставщика новгородского храма, и 19 августа 2004 г., в Москве, на праздник Преображения Господня, отец Александр Панкратов был рукоположен во диакона. В феврале 2006 г. Великий Новгород посетил митрополит Корнилий и 15 апреля 2006 г., в Москве на Рогожском кладбище состоялась священническая хиротония о. Александра, теперь в храме идут регулярные службы, совершается литургия.
Настоятель храма РПСЦ во имя св. Иоанна Богослова иерей А.В. Панкратов - историк, преподаватель Духовного училища при Московской митрополии РПСЦ, читает спецкурс "История старообрядчества" для студентов - историков Новгородского университета и преподаёт его на философском факультете.
http://turbina.ru