Старинное село Ярцево расположено на левом берегу Енисея, на восточной окраине Енисейской равнины, в 230 км (по прямой) к северу от Енисейска. Датой основания села считается 1605 (по др. данным - 1608) год, когда отрядом казаков из Кетского острога, находящегося на берегу реки Кеть, правого притока Оби (ныне - урочище в Колпашевском районе Томской области) было поставлено на стрелке рек Енисея и Симы зимовье, из которого затем выросло село, переместившись ненамного выше по течению Енисея. Это было одно из первых русских поселений в Енисейском крае. Первыми жителями Ярцево были архангелогородцы, вологжане и новгородцы.
В 1679 году в Ярцево была построена первая деревянная церковь во имя Благовещения Пресвятой Богородицы, одним из предназначений которой было обращение в православную веру кетов и эвенков. Каменный храм в Ярцеве был построен с тем же посвящением в 1796 году. Имеется описание храма, сделанное в 1832 году: "Церковь каменная, одноэтажная, длиною одиннадцать сажен, шириной пять сажен". В церкви находился придел во имя Петра и Павла. Иконостас состоял из 36 икон. На колокольне висело четыре колокола: большие 8 и 10 пудов и два малых по 1 пуду. При церкви существовала библиотека, насчитывающая 51 книгу, в их числе Евангелие в кожаном переплете, отпечатанное в Москве в 1743 году.
В состав Ярцевского Благовещенского прихода входили кроме самого села соседние деревни: Нижне-Шадрино, Фомка, Никулино и Тонковское зимовье, а также всё инородческое население данной местности. В 1911 году в Никулино, а в 1916-м - в Нижне-Шадрино были построены часовни. Последним дореволюционным священником был отец Серафим Прозоровский. Он же был преподавателем министерского училища. Последним приходским старостой до 1917 года был Григорий Максимович Шадрин.
Благовещенскую церковь закрыли не позже 1930-х годов, а затем разобрали на кирпич. Сейчас на её фундаменте стоит контора зверопромхоза.
Со второй половины XIX века по 1924 год село находилось в Анциферовской волости Енисейского уезда Енисейской губернии. В 1876 году в Ярцеве было 29 дворов, в которых проживало 70 человек. Занимались крестьяне рыбным и звериным промыслом, а также перевозкой грузов на золотые прииски. Местные меха славились во всем мире, продавались по самой высокой цене, т.к. были отменного качества. Сотни пудов красной и другой благородной рыбы добывались ярцевскими рыбаками и отвозились на продажу в Енисейск.
В 1891 году в селе была открыта церковно-приходская школа, а в 1907 году - одноклассное училище Министерства Народного Просвещения. С 1912 года казною в районе с. Ярцево была начата заготовка леса для вывоза за границу через устье Енисея. Это способствовало увеличению численности населения села. Согласно статистическим сведениям, на конец 1919 - начало 1920 годов в селе проживало уже 178 мужчин и 186 женщин. Не обошло стороной село и такое явление как сибирская ссылка. Сюда царские власти ссылали участников польских восстаний, народовольцев, эсеров, анархистов, а большевики - кулаков, троцкистов, прибалтийцев, немцев и калмыков.
Ярцевский Благовещенский приход был восстановлен в 1995 году стараниями инокини Хрисии (Косенковой). В феврале следующего года администрация села передала под строительство нового здания церкви участок земли с недостроенным кирпичным домом. Благочинный Енисейского района протоиерей Геннадий (Фаст) освятил место, и строительство храма началось. Он был возведен на пожертвования прихожан, предприятий и организаций за один год.
На кирпичное основание был положен сруб новой церкви. В целом, получился каменно-деревянный храм, клеть основного объёма которого крыта четырёхскатным колпаком, по боковым стенам проходят галереи, а восточная стена пяти стенного алтаря опирается на кирпичные колоны. Над входом в храм, выполненном в виде высокого крыльца с боковыми всходами, возвышается звонница.
7 апреля 1997 года впервые после большого перерыва колокольный звон созвал ярцевских христиан на службу.