Название местности в северной части современной Красной Пресни возникло в связи с переводом во 2-й половине XVII в. Псаренного двора от Старого Ваганькова в Занеглименье к западу от Кремля - в район "Трех гор", названный Новым Ваганьковым. Во время эпидемии чумы 1771 г. на территории бывшего Псаренного двора открыто Ваганьковское кладбище. Наименование "Ваганьково" связывают с "вагантами" - царскими шутами, жившими дворами в Ст. Ваганькове (ныне М. Знаменский пер. и Староваганьковский пер.). М. М. Сухман производит имя от переселенных в Москву воган (важан) - жителей Важской области.
В XVIII в. здесь стояла деревянная церковь Иоанна Милостивого. Сюда было произведено третье переселение Ваганьковской слободы в 1675 г., причем перевезли и старую церковь. После четвертого переселения в 1696 г. к урочищу Три Горы на месте третьего остались каменные погребальные плиты, почему в 1772 г. и оказалось удобно устроить "на Ваганькове" одно из общегородских кладбищ. 7 января 1773 г. тут освятили деревянную церковь Иоанна Милостивого. Каменная с главным престолом Воскресения Словущего выстроена в 1824 г. На месте деревянной церкви был поставлен памятник: небольшая ротонда с колоннами наверху и арками внизу. Приделы: северный в храме - Иоанна Милостивого, южный в храме - Феодора Сикеота, северный в трапезе - Акилины мученицы, южный в трапезе - Николая Чудотворца.
Паламарчук П. Г. Сорок сороков. Т. 3: Москва в границах 1917 года. - М., 1995, с. 27-31