Впервые сельцо Мишино, что на р. Ямна, упоминается в платежных книгах 1594-1597 гг. В окладных книгах 1676 г. в селе значится Никольская церковь с 64 приходскими дворами, в их числе 3 двора боярских. В середине ХIХ века обветшавшую церковь решено было перестроить в камне. Согласно ревизии 1858 г., селом в разные годы владели помещицы Кропоткина, Гололобова и помещики Межениновы. Каменный Никольский храм строился на средства поручика П. С. Меженинова с 1856 по 1865 гг.
Церковь была освящена 10 октября 1865 г. и с 1873 г. значилась приписной к Покровской церкви села Злыхино. В 1897 г. в трапезной части храма освящён Казанский придел. Тип постройки — «храм под звоном», т.е. колокольня располагалась по центру здания, над трапезной храма. У церковного алтаря находилось захоронение героя Русско-Турецкой войны генерала Александра Меженинова и его брата — начальника строительства Транссиба Николая Меженинова.
Причт при церкви села Мишина до 1867 г. состоял из священника, диакона и двух причетников. В 1867-м вакансия диакона была упразднена. С 1873 г. церковь значилась приписной к Покровской церкви села Злыхино без особого причта. В конце ХIХ века самостоятельность прихода была восстановлена. В 1929 г. в селе был образован колхоз имени Будённого.
В 1950 г. в результате укрупнения хозяйства стали частью колхоза «Примерный труд», впоследствии — совхоза «Большевик», который использовал здание бывшей церкви в своих целях. После ареста последнего настоятеля Никольского храма о. Созонта Решетилова в 1937 г., мишинский храм разорили, а кресты сбросили на землю. В начале 1941 г. по решению властей храм был закрыт и подлежал «переоборудованию под культурные цели», но помешала Великая Отечественная война... Спустя некоторое время коммунисты устроили в бывшем храме семенной склад колхоза имени Будённого. Одновременно колокольню разрушили, разобрали притвор, захоронение Межениновых осквернили. Со временем церковное здание было брошено на произвол судьбы...
К концу 1980-х гг. от церковного здания остался лишь нижний ярус трапезной, подвергавшийся разрушениям из года в год благодаря катаклизмам природы. Стоит сказать, что на несущих стенах, чудом сохранились фрагменты настенных росписей на библейские сюжеты. Только после распада СССР обезображенный храм был передан созданной православной сельской общине в 1998 г. В 2006 г. началось его восстановление, которое было завершено в 2010 г.: отремонтирована кровля, сооружена колокольня с крестом, устроен иконостас. Вновь был возведен кирпичный притвор и в здании церкви устроена система отопления.
Храм во имя Николая Чудотворца действующий — в нём регулярно совершается Божественная Литургия, служатся молебны и панихиды. У церковного алтаря находится захоронение героя русско-турецкой войны генерала Александра Меженинова (+1910) и его брата — создателя Транссиба Николая Меженинова (+1901).
По материалам: http://www.vidania.ru/temple/temple_mosobl/zaraiskii_raion_nikolskaya_zerkov_mishino.html
