Никольский монастырь был основан в конце 19 века. До революции 1917 года в монастыре было два храма, каменный Никольский собор, освященный в 1915 году, и деревянная церковь. В 1928 году храмы монастыря были снесены . Из кирпичей собора было построено административное здание в городе Горно-Алтайске. А на месте храмов было построено СИЗО. Монастырские корпуса были заселены. В 2010 году начато расселение. Однако после расселения бывшего келейного корпуса он был разобран. Возвращение монастырских зданий Церкви не предвидится.
Неподалеку находится Никольский источник, особо почитаемый верующими.