Эта церковь составляет юго-восточный угол монастырского корпуса; построена из камня вчерне в 1813 году, на место прежней обветшалой деревянной, тоже во имя Святителя Николая Чудотворца. В длину с алтарем и папертью она имеет 9, а в поперечнике - три сажени. Иконостас в этой церкви весьма древний, тот самый, который был до шведского разорения, и был сохранен от истребления в это бедственное время в Новгородском Деревяницком монастыре; по возобновлении обители обратно возвращен из Новгорода.
Иконостас без резьбы, блистающий золотом, но весь писан рукою художника довольно искусного и содержит в себе исключительно некоторые события из жизни Святителя Николая, Мирликийского Чудотворца. Церковь эта освящена 12 июня 1815 года строителем Иларионом и по расположению своему есть больничная и, вместе с тем, кладбищенская.
Она имеет две паперти. Одну с восточной стороны, в которой похоронены тела благотворителей обители: действительной статской советницы Пефт, урожденной Ганжевичевой; коллежского советника В.П. Балясного и супруги его Т.А., урожденной Мединцовой, по первому браку Ганжевичевой, а также детей сих последних: Василия, Николая, Платона; тещи Балясного, Елизаветы Мединцовой и лейб-гвардии Измайловского полка полковника В.М. Ганжевича. Другая паперть с западной стороны; здесь погребены тела рабов Божиих: монаха Корнилия, бывшего 40 лет бессменно отличнейшим рыбаком обители, умершего 107 лет от роду; с.-петербургского купца И. Г. Кокушкина; московского купца Кекшева; рясофорного монаха Петра; иеромонаха Иустина и игумена сей обители Никона.
«Историко-статистические сведения о С.-Петербургской епархии». Выпуск 1, Санкт-Петербург, 1869 г. Печатня В.И. Головина, Владимирская, д. № 15, кв. № 3.