С.-Петербургская 3 гимназия находится в Гагаринской улице Литейной части, подле Пустого рынка. В основание этой гимназии легло устройство учебного заведения, основанного по высочайшему повелению императора Александра I, данному 25 октября 1817 г., и назначенного для приготовления учителей для уездных и приходских училищ. Оно носило название " Второй разряд педагогического института".
К началу 1819 г. уже собран был состав начальствующих и учащихся института, хотя на самом деле институт еще не существовал. Между тем, 18 февраля 1819 г. главный педагогический институт преобразован был в С.-Петербургский университет, а потому и предположенный к открытию Второй разряд педагогического института переименован был в учительский институт, состоящий в ведомств С.-Петербургского университета, и под этим названием открыт был 19 сентября 1819 г. в доме митрополита римско-католических церквей в России Станислава Сестренцевича-Богуша, на Большой Мещанской улице; правильные учебные занятия начались в нем с января 1820 г., но по окончании перестроек, 26 марта 1822 г. институт переименован был в пансион казенных гимназистов, а позже переименован был в С.-Петербургскую гимназию, которая должна была приготовлять учителей для низших училищ и студентов для университета, и состояла под ведением правления университета.
Тогда же предположено было переместить гимназистов в казенный дом, в котором и доселе помещается гимназия. Дом этот, близ Пантелеймоновской церкви, принадлежавший прежде партикулярной верфи, пожалован был в 1788 г. императрицею Екатериною II приказу общественного призрения; впоследствии занят был уездным Пантелеймоновским или малым народным училищем, но по тесноте и ветхости требовал разширения и значительных поправок. Все это было произведено в 1822 г. В этом-то разширенном и исправленном здании и открыта была С.-Петербургская гимназия 26 января 1823 г., которая с 1831 г. стала называться 3 С.-Петербургскою гимназиею.
До устройства церкви в здании гимназии воспитанники ее ходили к богослужению в воскресные и праздничные дни в Пантелеймоновскую церковь. Дело об устройстве гимназической церкви началось в 1825 г. по плану архитектора Щедрина, утвержденному 3 мая 1825 г., но шло очень медленно. Из дел гимназической канцелярии видно, что тогдашний попечитель учебного округа Д.П. Рунич взял на себя обязанность устроить церковь хозяйственным способом, и из 30 000 руб. ассигн., взятых из экономических сумм гимназии на разные предметы по устройству гимназическаго дома, определил 10 000 руб. собственно на церковные принадлежности, а израсходовал из них 2 600 руб. на приобретение плащаницы, запрестольного креста и образа Спасителя, которые написаны были Брюлловым.
В 1832 г. храм уже окончательно был устроен и 12 мая освящен преосв. Смарагдом, епископом ревельским, викарием С.-Петербургским. Антиминс, имеющийся в храме, священнодействован преосв. Леонтием и подписан преосв. митрополитом Исидором. Храм, устроенный в здании гимназии, имеет вид продолговатого зала в 11 саж. длины, 4 саж. ширины и 2 саж. 1 арш. высоты, с хорами на западной стороне. В 1876 г., при местном священнике Василии Перетерском и церковном старосте Иване Кобылине, с согласия гимназического начальства и разрешения епархиальной власти, по плану архитектора Дакушевского, одобренному строительнымъ комитетом, каменные стены церкви надстроены на 2 с четвертью аршина, и на такую же высоту поднят потолок всей церкви, кроме алтаря, так что потолок, плоский по середине, посредством поддуг склоняется на 4 стороны к карнизу и имеет вид овального свода.
В это же время на главном фасаде церковного здания поставлен бронзовый позолоченный крест, а в особо устроенном помещении повешен звон из 5 колоколов, в коих весу около 15 пудов. Все это вместе с переделкою церкви заново обошлось в 3 500 руб. сер., из коих 2000 руб. уплачено из церковных сумм, скопленных от продажи свеч и от сбора в кружку на украшение храма, а 1500 руб. из собственных средств старосты Кобылина.
Иконостас одноярусный, деревянный, столярной работы, с 2 коринфскими колоннами, у которых базы деревянные, токарные, а капители лепные, алебастровые. В нем 5 икон, писанных на холсте: Спасителя, Божией Матери, архангела Михаила, архидиакона Стефана и Тайной Вечери. Последняя икона в серебряной ризе, пожертвованной в 1857 г. неизвестным благотворителем: в ней весу 8 фунт. и 53 золотника. Пол в алтаре и церкви паркетный. Утварью и ризницею церковь снабжена вполне достаточно, так что в этом отношении она может считаться одною из самых богатых домовых церквей в столице.
На содержание церкви полагается 150 руб. в год из пансионной суммы. Но собственно все приобретения церкви вместе с содержанием делаются на свечную и кружечную сумму, которою заведует причт со старостою, записывая приход и расход в шнуровую книгу и, по истечении года, давая отчет начальству гимназии. Метрические книги ведутся с 1849 г., а до этого времени запись родившихся и умерших вносилась в книги Пантелеймоновской церкви. Обыскной книги не имеется. Церковная библиотека, заведенная в 1859 г., с разрешения начальства гимназии, настоятелем церкви К. Добронравиным, помещается на хорах и, кроме богослужебных книг, имеет духовные журналы за несколько лет. Книги приобретаются на деньги, отчисляемые от свечной и кружечной суммы.
«Историко-статистические сведения о С.-Петербургской епархии» Выпуск 6, Санкт-Петербург, 1878 г. Напечатано в синодальной типографии.