Однопрестольный храм Божией Матери Иверской был выстроен в 1846 - 1847 годах на средства Удельного Ведомства (государственное ведомство, управлявшее крестьянами, принадлежащими царской династии). Строительство храма было связано с созданием в Алатыре первого женского "хозяйственного училища для крестьянских дочерей". Училище было открыто 1 мая 1845 года, там училось поначалу 20 девиц, через некоторое время уже 36. Для воспитанниц образцового женского училища и была построена "Иверская Богородичная" (так она называлась в старых документах) церковь.
Под училище с церковью Алатырский городничий выделил 4 800 квадратных сажень земли. На этой земле было выстроено несколько зданий, из которых в главном помещалась церковь, рабочая и классная комната. В других зданиях находились спальни воспитанниц, их столовая и квартиры служащих. Кроме того имелись многочисленные подсобные помещения: большой коровник, свиной хлев, овчарня, птичник и погреб. При училище имелось два больших огорода и сад. Позднее прибавились еще образцовые избы, в которых поселялись на год и более по 5-6 воспитанниц, обязанных вести там самостоятельное хозяйство. Училище просуществовало до 60-х годов девятнадцатого века. Церковь же продолжила свое существование и далее.
Архитектор храма в имеющихся скудных документах не назван, но можно предположить, что им был Абакумов Василий Панфилович (род.1813 - ум. после 1877), архитектор Алатырской удельной конторы, которой принадлежало училище с церковью. Василий Панфилович окончил Императорскую Академию Художеств в Санкт-Петербурге по классу архитектора К.А.Тона (автора проекта знаменитого храма Христа-Спасителя в Москве) в 1837 году, получив звание свободного художника за представленный проект сельской церкви на 500 человек. С 1841 года по 1861 год он служил в качестве архитектора сначала в Симбирской, а затем в Алатырской удельной конторе, которая в 1846-1847 году и построила женское училище с храмом.
Церковь была закрыта в 1919 году, затем вновь зарегистрирована в 1924 году и окончательно закрыта в 1929. Впоследствии здание храма использовалось под нужды больницы. В 70-е и 80-е годы ХХ века здесь располагалась станция переливания крови и красный уголок больницы.
Храм был возвращен Русской Православной Церкви в 2003 году. Инициатором и организатором восстановления храма был игумен (ныне архимандрит) Василий (Паскье), создавший для этой цели общину православных верующих.
16 января 2005 года храм был вновь освящен Митрополитом Чебоксарским и Чувашским Варнавой.
Источник: сайт Чебоксарско-Чувашской епархии
