Глубокое почитание Божией Матери иноки выразили в том, что первый построенный ими храм освятили в честь Покрова Пресвятой Богородицы (дата освящения -17 октября 1876 г.). Но этот храм постигла печальная участь. Во время русско-турецкой войны 1877-78 гг. он и другие постройки нижнего монастыря были разрушены или сожжены турками. После окончания военных действий братия принялась за их восстановление.
Новый храм был выстроен за четыре месяца и освящен 3 февраля 1879 г. В нем, в особом ковчеге, хранились святыни: частицы Древа Животворящего Креста, камня гроба Господня и семь частиц мощей святых, среди которых были мощи святого великомученика Пантелеймона, праведного Иосифа Обручника, святителей Митрофана Воронежского и Тихона Задонского. К великому сожалению, все они были утрачены после закрытия монастыря советской властью в 1924 г. Здесь же вначале находилась перенесенная из Старого Афона чудотворная икона Божией Матери "Избавительница".
С восстановления разрушенной Покровской церкви началось строительство всей новоафонской обители. Позже иноки построили придел, освятив его во имя Святого архистратига Михаила (6 июля 1883 г.).
Храм значительно пострадал в годы советской власти.
Сведения из брошюры-путеводителя "Абхазия. Христианские святыни Нового Афона". - Агенство по недвижимости и туризму "Юг", г.Сухум, 2003г.