Первая деревянная церковь на этом месте была возведена в середине XVIII века первым владельцем села Тарханы Яковом Долгоруковым и освящена в честь Николая Чудотворца. В 1826г. на её месте началось строительство каменной церкви во имя Архистратига Божия Михаила на деньги владелицы села Е.А. Арсеньевой - бабушки М.Ю. Лермонтова. Старая же церковь была перенесена на сельское кладбище, где служила часовней. Сам поэт видел церковь только недостроенной, когда в 1836г. проводил в имении бабушки отпуск. Строительство её было завершено в 1839г, а в 1840 состоялось освящение. Вероятно, именно в церкви Михаила Архангела 21 апреля 1842г. был на два дня установлен доставленный из Пятигорска гроб с телом поэта. В настоящее время интерьер церкви воссоздан стараниями работников музея-заповедника Тарханы и реставраторов, в храме проводятся богослужения. За одной оградой с церковью также находится Часовня-усыпальница Лермонтовых, где похоронен поэт.