Первое упоминание о церкви в с. Атепцево появилось в XIV в. В 1614 г. здесь существовала ветхая деревянная церковь Николая Чудотворца. Во время польско-шляхетского нашествия церковь не была разорена, но из-за ветхости ее разобрали. Из соседнего с. Покровка перевезли деревянный храм в честь Покрова Пресвятой Богородицы и устроили там придел во имя свт. Николая. Эта церковь простояла в Атепцеве 280 лет.
В 1897 г. стараниями священника Гавриила Молчанова начато строительство каменного храма. Храм строился на средства владельца бумажной фабрики А.И.Чижова и фабриканта В.В.Якунчикова, а также на пожертвования прихожан. 25 июня 1897 г. храм освятили.
Церковь построена из кирпича, оштукатурена, внутри окрашена масляной краской. В 1929 г. ее закрыли и приспособили под клуб. В 1936 г. Никольскую церковь взорвали. В 2001 г. при храме зарегистрирована община. В настоящее время выстроена небольшая деревянная церковь.