Перед нами единственный памятник древнерусского деревянного зодчества на Ярославской земле. Сооружённая в конце ХVII столетия, эта церковь находится в удивительно живописном месте, овеянном древними преданиями. Именно здесь на реке Ишне преподобный Авраамий встретил апостола и евангелиста Иоанна Богослова и получил от него благословение на подвиг утверждения христианства в Ростовской земле. Кроме того, он передал тростниковую трость, которой Авраамий снёс идола бога Велеса и основал на месте языческого капища Богоявленский Авраамиев монастырь.
Храм святого Иоанна Богослова построен, как принято говорить, "без единого гвоздя" в 1689 году архимандритом Авраамиевского монастыря Герасимом в память явления на этом месте Иоанна Богослова Авраамию Ростовскому. Церковь построена на месте старой. Существует легенда, что её не строили, а она сама приплыла по реке. Но это всего лишь легенда. Возможно, сплавили всего лишь готовый сруб церкви по реке до места его установки, так часто поступали строители в то время. Массивные брёвна, образующие его сруб, не соединены металлическими креплениями, а держатся за счёт собственной тяжести, тщательной обработки и поразительно точной подгонки. Силуэт церкви красив и гармоничен. Если посмотреть на храм с севера или юга, он напоминает корабль, раскинувший паруса, а если взглянуть на него со стороны алтаря, он похож на высокую горящую свечу. В начале ХIХ века к храму с западной стороны была пристроена колокольня, которая заменила собой древнее высокое церковное крыльцо. Её колокола, небольшие, но благозвучные, сохранились до наших дней. Гульбище сохранилось с правой части храма. Левая часть была за ветхостью разобрана в ХIХ веке. Тогда же храм был обшит тёсом. После разборки левого гульбища симметрия храма нарушилась и пришлось под оставшуюся часть гульбища подвести фундамент.
В 1888 году великий русский художник С. В. Верещагин во время своей поездки по Русскому северу запечатлел гульбище на своей картине "Паперть в Русской церкви. Ожидание исповеди". Как выглядел храм во время Верещагина, можно увидеть на его картине "Внутренний вид церкви Иоанна Богослова на Ишне близ Ростова Ярославского. 1888 г." Этот храм в своё время посетили: Его Императорское Высочество, Великий князь Константин Константинович 25 мая 1901 года и 22 мая 1913 года Государь Император Николай II с наследником Цесаревичем Алексеем Николаевичем, Августейшими дочерьми Ольгой Николаевной, Татьяной Николаевной, Марией Николаевной и Анастасией Николаевной", о чём свидетельствуют памятные таблички, прикреплённые сбоку от входа в храм.
Трапезная, полутёмная галерея с волоковыми окнами резко контрастирует с высоким, наполненным светом пространством самого храма. Его стены настолько выструганы, что кажутся полированными. Образы из иконостаса и резные позолоченные Царские врата 1562 года работы мастера Исайи экспонируются в Государственном музее-заповеднике "Ростовский кремль". В самом же храме находится точная копия Царских врат. В настоящее время храм апостола Иоанна Богослова - филиал Ростовского музея. Дважды в год - в дни празднования памяти святого Иоанна Богослова (21 мая и 9 октября) - в нём проходят богослужения. Как правило, их возглавляет правящий архирей Ростово-Ярославской епархии. Для того, чтобы попасть в храм, необходимо обратиться к смотрителю. Он проживает в щитовом доме, расположенном с правой стороны при въезде в село на повороте дороги.
Из путеводителя: Рубцова Мария, Виденеева Алла "Ростов Великий. Святыни и достопримечательности". - Изд-во Спасо-Яковлевского Димитриева монастыря, 2019