Училищная церковь находилась в центральном ризалите четвертого этажа. Снаружи, на фронтоне, место церкви отмечал крест. 19 февраля 1901 г. епископ Нарвский Никон освятил церковь. Одноярусный иконостас с шестью образами был сделан из белого и цветного мрамора. От соседнего рекреационного зала церковь отделялась аркой с балюстрадой и закрывалась металлическим занавесом. Церковь закрыта 3 октября 1921 г.