Село Домнино до 1764 года принадлежало Троице-Сергиеву монастырю; оно было приложено в этот монастырь вместе с деревней Зеховой царем Федором Ивановичем в 1588 году. В писцовых книгах Троицких вотчин 1593 года значится, что в селе Домнине церковь Илии пророка с приделом Николая Чудотворца, теплая церковь Андрея Стратилата — древяна вверх — строение приходских людей, при церкви поп, дьячок и пономарь; на церковной земле 5 келей нищих, в селе двор монастырский, 12 дв. крестьянских и 2 бобыльских, 7 дворов церковных пустых.

Более подробные сведения о церкви в селе Домнине находятся в писцовых книгах 1630 года: «в Домнине церковь Св. пророка Илии с приделом во имя Св. Николая Чудотворца, а в церкви Божия милосердия образ местный св. пр. Илии в окладе серебряном, венец позолочен, образ Св. Николая Чудотворца около главы венец серебряный, два образа окладных — Спасов и Преч. Богородицы - обложены серебром позолоченным, венцы с каменем и жемчуги. Евангелие напрестольное с Евангелисты — письменное, апостол письменный... ризы и стихарь полотняные — оплечье выбойка черная... сосуды деревянные... У Преч. Богородицы запрестольной прикладу серьги серебряные позолочены... На колокольнице два колокола. Тут же место церковное Андрея Стратилата, а храму нет. При церкви двор попа Михаила, дворы дьячков и просвирницын, на церковной земле 1 двор бобыльский. В селе 14 дв. крестьянских и 2 бобыльских».

Таким образом церковь в Домнине несомненно существовала уже в конце XVI столетия. В тех же писцовых книгах упомянуты и некоторые из приходских деревень Домнина: дер. Славцева — в ней тогда было 4 дв. крестьянских, дер. Ливенда — в ней 11 дв. крестьянских, Панова — в ней 1 дв. прикащиков, 1 дв. делового человека и 1 крестьянский двор пустой, дер. Зехова — в ней 18 дв. крестьянских и 1 бобыльский.

Полные сведения о Домнинском приходе имеются в окладных книгах 1676 года. «В Домнине, говорится здесь, церковь Св. пророка Илии, при ней двор попа Максима, пономарев, да в приходе 19 дв. крестьянских и 1 бобыльский, да на церковной земле живут нищие, дер. Сала, в ней 2 двора помещиковых, 9 дв. крестьянских и 2 бобыльских (в 1896 г. здесь 131 двор), дер. Паново, в ней 1 двор боярский, а в нем живет прикащик, 14 дв. крестьянских (в 1896 г. здесь 59 дворов), дер. Крутая — 8 дв. крестьянских (в 1896 г. здесь 27 дворов), дер. Зехово—7 дв. крестьянских и 1 бобыльский (В 1593 году и дер. Зехове было 5 дв. крестьянских и 1 бобыльский.), дер. Славцево—12 двор. крестьянских и 2 бобыльских (в 1896 г. здесь 73 двора), дер. Кузнецово — 4 дв. крестьянских и 2 бобыльских (в 1896 г. здесь 10 дворов). Да к той же церкви приписана деревня Левенда по челобитью той деревни жителей и потому, что та деревня от иных сел отдалена, в ней 25 дв. крестьянских (в 1896 г. здесь 89 дворов). Земли церковной по 10 четв. в поле, сенных покосов на 15 копен».

По ревизии 1742 года в селе Домнине числится 103 души муж. пола, а по ведомости доходов, полученных Троицкой лаврой в 1761 году значится, что с крестьян села Домнина получено оброку 103 руб. и на покупку монашествующим на свиты холста собрано 5 руб. 84 коп.

В 1782 году доселе бывшая в Домнине церковь сгорела и вместо нее к 1785 году построена новая деревянная же церковь. Собственно построена была не совсем новая церковь, а перевезена церковь из села Шиморского (В 1778 году на средства известного заводчика Баташева, которому тогда принадлежало Шиморское, начат был постройкой каменный храм.) и здесь только перестроена. В этой церкви устроены были те же престолы, что и в прежде бывшей.

В 1862 году эта церковь была разобрана и частью из старого, а частью и из нового материала построена в Домнине вновь деревянная же церковь.  Престолов в ней два в ряд: во имя св. пророка Илии и Св. Николая Чудотворца.

Утварью, ризницей, Св. иконами и богослужебными книгами церковь снабжена достаточно. Замечательного по древности или ценности в церкви не имелось. Сравнительно древни серебряные вызолоченные сосуды потир и дискос — 1782 года, приложенные Вас. Юшковым. В церковном архиве хранились две грамоты: 1) на построение церкви после пожара 1785 года и 2) на освящение этой церкви 1785 года. 

Причта при церкви по штату положено: два священника, диакон и два псаломщика. На содержание причта получалось: жалованья от казны 950 руб., от служб и требоисправлений, земли и хлебного сбора до 900 руб. Дома у членов причта собственные на церковной земле. 

Земли при церкви: усадебной 1 дес. 816 кв. саж., сенокосной 5 дес. 142 саж., выгонной 2 ½ дес. и пахотной 25 дес. 142 саж.; земля эта значилась в плане крестьянской земли. Кроме сего имелось так называемой писцовой дачи 4 десят. 1442 саж. пахотной земли.