Православная община в с. Багаевка Саратовского района начала создаваться в 2006 году. Первоначально православные верующие с. Багаевка собирались для совершения богослужений в помещении Дома культуры села, предоставленном местной Администрацией.
8 сентября 2007 года на месте будущего строительства храма был установлен крест. Строительные работы начались в сентябре 2009 года. 27 ноября 2009 года Епископ Саратовский и Вольский Лонгин совершил Чин основания храма.
6 октября 2010 года благочинный Саратовского округа протоиерей Владимир Пархоменко совершил освящение креста и купола на храм.
Работы велись при поддержке главы администрации Саратовского района А.П. Зотова, попечением Саратовского общественного благотворительного фонда «Православие и современность» (директор фонда С.Г. Курихин).
06 июля 2011 года Преосвященнейший Лонгин, Епископ Саратовский и Вольский, совершил Чин великого освящения храма
08 сентября 2013 года Митрополит Саратовский и Вольский Лонгин совершил чин освящения колоколов вновь выстроенной звонницы храма.